Finaleの無料版Finale Notepadを使って「曲の途中で調号・拍子記号の変更」する方法がないか聞かれたので実験してみたところ、簡単にできたのでノウハウとして公開しておきます。
Finaleの比較表にあるとおり、本来Finale Notepadでは機能制限があり、転調や変拍子の楽譜を作れません。しかし、Finale Notepad 2008からはMIDIとの連携が強くなりMIDI音源の使用やSMFの読み書きができるようになりました。そのSMFの読み込みを利用することで拍子や調を曲中で変えることができます。
ちなみに既存の曲を転調したり拍子変更したりする作業は恐らくうまくいかないので、記譜作業に入る前に調や拍子を確定しておく必要があります。
用意するソフトは
Finale Notepad 2008
Domino
の2つです。
以下作業工程
i)Domino
1.起動
2.編集→調号
3.編集→拍子
4.ファイル→SMF書き出し

ii)Finale
1.ファイル→開く
2.ファイルの種類:スタンダードMIDIファイル
3.Dominoで作ったファイルを開く
これでできてるはず。
いちおう書きかけのMUSファイルを基に転調・拍子の変更せざるを得ない場合にも理屈上はこの方法が使えますが、記譜上のニュアンスがなくなり、小節がズレるのでオススメはしません。
i)Finale
1.目的のファイルを開く
2.ファイル→別名で保存
3.ファイルの種類:スタンダードMIDIファイル
ii)Domino
1.Finaleで作ったmidiファイルを開く
3.小節番号を確認する(右下+-で縮小可)
4.編集→調号
5.ファイル→SMF書き出し
iii)Finale
1.ファイル→開く
2.ファイルの種類:スタンダードMIDIファイル
3.Dominoで作ったファイルを開く
個人的には曲の打ち込みならFinaleよりDominoなど、楽譜作成ならRosegardenがお勧めではあります。両方とも無料・フリーですし、日本語対応ですし。
追記:
satommyさんから、この記事をベースにFinaleでギター譜を作ろうという記事を書いてくださったのコメントをいただきました。ありがとうございます。
このノウハウに関連した記事を書いたのでそこからリンクさせて頂いているのですがよろしいでしょうか? こちらです
http://oneguitar.spaces.live.com/blog/cns!5C3C4FE426855CE4!276.entry
これでいちいち#とか♭使わなくてすみます><